单细胞蛋白质组学分析通过对单个细胞内的蛋白质组成、丰度和翻译后修饰进行深入研究,从而揭示细胞功能和状态的动态变化。与传统的蛋白质组学方法不同,单细胞蛋白质组学能够有效应对细胞异质性的问题,通过高效的单细胞分选技术,精确分离出单个细胞,并利用质谱技术对分离的蛋白质进行高分辨率分析。该技术能够获取单个细胞内的蛋白质信息,包括翻译后修饰等关键功能特征。通过高通量的质谱分析和定量技术(如TMT标记),突破传统蛋白质组学在细胞异质性和微量样本分析中的局限,成为细胞生物学、疾病研究和精准医疗领域的重要工具,提供更加精细和全面的细胞层面数据。
百泰派克生物科技先进的单细胞蛋白质组学分析服务平台集成了Thermo最新一代Orbitrap Astral高分辨质谱仪和Bruker timsTOF HT设备,结合全流程自动化的单细胞分选系统CellenONE。能够在高度异质性的生物样本中,实现精确、稳定检测与分析,满足高灵敏度与高重复性的研究需求。
单细胞蛋白质组学分析服务工作流程
百泰派克生物科技单细胞蛋白质组学分析旨在揭示单个细胞内的蛋白质组成、丰度和翻译后修饰状态,帮助科研人员深入理解细胞的异质性与功能状态。我们的服务涵盖从样品处理到数据分析的全部过程,以下是完整的工作流程:
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样品接收与预处理
样品接收后,首先进行质量控制与初步分析。
百泰派克生物科技提供细胞分选服务,采用先进的压电声学分配技术进行细胞分离。能够最大程度地减少剪切应力和细胞损伤,确保单细胞分离的高效性与细胞存活率。对于样本中难以分离的低数量细胞,通过高精度的光学监控系统进行可视化操作,确保高成功率和低损失率。
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单细胞分选
单细胞分选是单细胞蛋白质组学分析服务的核心步骤之一。我们采用的CellenONE自动化分选平台,通过微流控技术精确分配单个细胞至纳升级的液滴中。与传统分选方法相比,CellenONE平台能实现极高的分离率(>98%),同时保持单细胞的生物活性,为后续分析提供可靠的样本基础。
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样品前处理与蛋白质提取
高效的样品前处理,以从单个细胞中提取足够的蛋白质进行后续检测。我们使用无损蛋白前处理方法,通过优化的酶切反应实现蛋白质的高效裂解和消化。这一过程在微升级反应器中完成,显著减少了样品的损失,并提高了蛋白质的酶切效率。
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蛋白质质谱分析
蛋白质提取与前处理完成后,样品将使用高灵敏度的质谱设备进行分析。
百泰派克生物科技配备了业内领先的Thermo Orbitrap Astral质谱仪和Bruker timsTOF HT质谱仪,单细胞蛋白质组学质谱技术能够提供高分辨率、高灵敏度的蛋白质定性和定量分析。这些高端质谱仪可精确识别和定量蛋白质及其翻译后修饰,确保得到全面、精准的单细胞蛋白质组数据。
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数据分析与结果解读
百泰派克生物科技采用先进的数据分析平台,结合算法和生物信息学工具对单细胞蛋白质组学质谱数据进行深入挖掘。通过对单细胞蛋白质组的定性分析,科研人员能够识别出特定的蛋白质种类及其丰度变化。同时,数据还将揭示蛋白翻译后修饰(如磷酸化、糖基化等)的动态变化,进一步帮助分析细胞的功能状态和异质性。
单细胞蛋白质组学分析服务优势
百泰派克生物科技致力于推动单细胞蛋白质组学技术的应用与发展,为科研人员和临床研究提供高质量的解决方案,从而在细胞功能解析和新治疗靶点发现中发挥积极作用。
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高相关性
相比于传统的单细胞RNA测序,单细胞蛋白质组学分析能够提供更直接、更精准的细胞功能信息。根据研究表明,bulk水平的转录本与蛋白质之间的相关性大约为0.5,而单细胞RNA与蛋白质之间的相关性仅为0.2 (Mol Syst Biol, 2022)。表明单细胞蛋白质组学技术能够更好地捕捉细胞真实的功能状态和生物学过程,在我们的技术平台下,能够通过高通量的单细胞蛋白质分析,能够帮助科研人员更准确地了解复杂生物系统中的细胞类型与功能。
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揭示蛋白翻译后修饰(PTM)的信息
蛋白翻译后修饰(PTM)是调控蛋白质功能的关键机制,而这类信息在mRNA数据中并未体现。通过单细胞蛋白质组学分析服务,研究人员可以获得翻译后修饰(如磷酸化、糖基化、乙酰化等)信息,进而理解蛋白质在细胞中的功能状态和调控机制。
百泰派克生物科技依托其先进的技术,能够为研究者提供高精度的PTM信息,帮助揭示细胞生物学过程中的复杂机制。
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转录调控与蛋白质活性调节的机制差异
单细胞RNA和蛋白质组之间的差异还表现在调控机制上。转录本水平的变异和蛋白质的变化之间并不总是呈现良好的相关性,这是因为转录本的合成与蛋白质的最终活性之间存在多种调控层次的差异(如翻译、翻译后修饰等)。单细胞蛋白质组学技术能够填补这一空白,帮助揭示转录和翻译过程中的重要机制差异。通过将转录组数据与蛋白质组数据结合,可以更全面地了解细胞生物学功能,形成更加精准的分子模型。
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稳定性与细胞异质性的揭示
蛋白质水平的数据相较于转录组数据更加稳定和直观,更能反映细胞的实际生理状态。蛋白质的表达和功能与细胞的形态、状态和功能密切相关,能够更准确地揭示细胞之间的异质性及个体之间的差异。例如,在肿瘤微环境中,肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞之间的相互作用往往通过蛋白质的表达和调控来体现,单细胞蛋白质组学可以帮助识别不同细胞类型和状态,从而揭示生理和病理现象。
为什么选择百泰派克生物科技?
我们的主要优势包括:
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先进的分析平台
百泰派克生物科技先进的单细胞蛋白质组学技术平台保证可靠、快速且高度准确的分析服务。
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一口价服务
我们的定价透明,无隐藏费用或额外费用。
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高数据质量
深度数据覆盖,严格的数据质量控制。人工智能驱动的生物信息学平台整合了所有单细胞蛋白质组学分析服务数据,为客户提供全面的数据报告。
中/英文项目报告
在技术报告中,
百泰派克生物科技会为您提供详细的中英文双语版技术报告,
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实验步骤(中英文)
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相关的质谱参数(中英文)
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质谱图片
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原始数据
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单细胞蛋白质分析详细信息
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 简称BTP)成立于2015年,从事以生物质谱为依托的多组学检测和生物制品表征。
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公司采用ISO9001质量控制体系,获批国家CNAS实验室认可,为客户提供符合全球药政法规级别的检测服务;
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业务范围覆盖蛋白质组、多肽组、代谢组、转录组、微生物组、生物制品表征、单细胞分析、生信云分析以及多组学整合分析等;
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7大质量控制检测平台,满足您一站式服务需求;
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服务3000+高校、科研院所、医院和企业,是10000+客户的选择!
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